Vedoucí oddělení: Ing. Petr Komínek, Ph.D.
Výzkumná činnost oddělení virologie je zaměřena na viry, fytoplazmy a jejich vektory s cílem vyvinout účinné metody ochrany proti těmto patogenům. V rámci výzkumného záměru jsou inovovány metody diagnostiky virů a fytoplazem napadajících významné plodiny, dále analyzována genetická diverzita těchto patogenů, zkoumány zdroje rezistence kulturních plodin k virovým a fytoplazmatickým patogenům a identifikovány molekulární markery rezistence, v neposlední řadě je též prováděna molekulární diagnostika fytoparazitických háďátek rodů Xiphinema, Longidorus, Paratrichodorus a Trichodorus, která přenášejí nepoviry. Je také prováděn výzkum rozšíření a variability virů a fytoplazem ovocných dřevin a révy vinné v rámci ČR. Zejména fytoplazmy jsou jako karanténní patogeny limitujícím faktorem množení a pěstování těchto plodin v ČR, obchodu s nimi a jejich produkty.
V rámci projektu 7. rámcového programu EU SharCo je komplexně řešena problematika ochrany proti viru šarky švestky, zahrnující jak hledisko molekulárně-epidemiologické, tak praktické aspekty šíření viru ve školkách, hledání zdrojů rezistence a identifikace molekulárních markerů. Výstupy projektu budou mj. i doporučení pro evropskou legislativu týkající se tohoto závažného karanténního patogena.